L'australià Michael Doohan (Honda) fou més ràpid que el català Àlex Crivillé (Honda) en la segona i darrera jornada d'entrenaments oficials del Gran Premi del Japó de 500 cc, que es disputà íntegrament sota la pluja, però la pole position definitiva va ser per al nord-americà Kenny Roberts (Suzuki), gràcies al registre del primer dia amb la pista eixuta.
Carles Checa (Yamaha) sortia aquesta matinada com a millor espanyol en aconseguir, també amb la pista eixuta, el millor temps dels entrenaments oficials. Checa sortí des de la tercera posició, mentre que Crivillé sortí des de la novena.
Roberts, que la segona jornada d'entrenaments patí una caiguda sense conseqüències quasi al final, no destacà molt amb la pista mullada, però sortí des d'una privilegiada posició.
El dubte sobre si plouria o no era allò que més procupava els pilots no només de 500 cc, sinó igualment als de 125 i 250 cc. El treball de tots els equips es va centrar en la posada a punt de les motos per a condicions especials de la pista banyada, sense saber com apareixeria a l'hora de la correguda.
